گروه مهندسی نرم‌افزار دانشگاه اصفهان همواره به عنوان یکی از باسابقه‌ترین گروه‌های کامپیوتری در سطح کشور شناخته می‌شده است. سابقه‌ی این گروه به سال‌های 1350 الی 1364 بازمی‌گردد که کامپیوتر به عنوان یکی از گرایش‌های رشته‌ی ریاضی در دانشگاه اصفهان موجود و از وجود استادان به نام و شناخته شده‌ای بهره می‌برد. در سال 1364 برای اولین بار رشته‌ی کامپیوتر به طور مستقل از طریق کنکور سراسری دانشجو پذیرفت و در سال 1367 دو رشته‌ی مهندسی کامپیوتر با گرایش‌های نرم افزار و سخت‌افزار در این دانشگاه راه‌اندازی گردید. در سال 1391، گروه مهندسی نرم‌افزار به عنوان یک گروه مستقل در دانشکده‌ی مهندسی کامپیوتر در دانشگاه اصفهان شکل گرفت.